โค้ดลับสังหาร SPY เรื่องราวของสายลับ วันหนึ่งมีคำสั่งจากเกาหลีเหนือให้อดีตสายลับปาร์คเฮริม (รับบทโดย เบจงโอ๊ค) ซึ่งขณะนี้เธอเป็นแม่บ้านธรรมดาอยู่ในเกาหลีใต้อยู่อาศัยมานานหลายปี เธอได้รับภารกิจที่จะเปิดปฎิบัติการและนำมาซึ่งลูกชายของเธอ คิมซอนอู (รับบทโดย คิมแจจุง) ยอดหัวอัจฉริยะที่มีไหวพริบปฎิภาณดีเยี่ยมซอนอูเป็นตัวแทนหน่วยข่าวกรองแห่งชาติทำงานให้กับองค์กร NIS (National Intelligence Service)ซึ่งแฟนสาวของเขา  ยูนจิน (รับบทโดย โกซองฮี)เป็นไกด์นำเที่ยวสำหรับนักท่องเที่ยวชาวจีน เธอพูดภาษาจีนไม่ได้ พวกเขารู้จักกันและตกหลุมรักกันเมื่อซอนอูช่วยเธอแปลเฮริมถูกบังคับให้เลือกระหว่างลูกชายของเธอหรือประเทศของเธอ เมื่อความเสี่ยงในชีวิตของเธอเริ่มจะมองเห็นจากทางที่เธอเลือก เธอจะทำเช่นไร จะเลือกอะไรระหว่างประเทศหรือลูกชาย เมื่อลูกชายรู้ความจริงแล้วเรื่องราวจะเป็นอย่างไร